菲律宾政府在马来西亚和文莱参与的斡旋下与南方的穆斯林社会实现了和平﹐承认穆斯林的平等公民地位﹐并且同意协助南方穆斯林地区的经济和文化发展。以马尼拉为中心的北方菲律宾人信仰天主教﹐历来排斥南方的穆斯林社会和伊斯兰文化﹐因此引发长期对抗﹐马尼拉政府在西方国家支持下多次对南方穆斯林大举用兵﹐但都无好结果﹐民族仇恨和宗教冲突越来越恶化﹐因此双方同意停战﹐实现和平。国会中支持民族和解的老议员们联名呼吁真正落实给予南方穆斯林平等的地位﹐例如教育。   多数党议长佛朗西斯说﹕“国会应当对待穆斯林公民诚实﹐既然承认他们是平等的公民﹐就应当帮助他们获得平等的生存权利。  穆斯林社会需要伊斯兰的教育﹐政府根据宪法精神必须保证每个儿童都能顺利地享受这个基本教育的权利﹐不能以宗教信仰对穆斯林歧视。”


　　在多数党的支持下﹐国会通过了上议院第1410号决议﹐批准了“2002穆斯林教育经费援助规划”﹐帮助穆斯林地区全面建设伊斯兰学校﹐承认他们是菲律宾的正规教育。   这个规划目的是协调穆斯林与全国的关系﹐同时保证地方教育制度与全国教育体系的接轨﹐学生可以顺利升学﹐进入高层次的学校。  过去穆斯林地区都是民办学校﹐现有的1171所伊斯兰学校﹐政府教育部只承认54所﹐给予少量经济资助﹐而且所有穆斯林学校的设备﹑教室﹑奖学金﹑学生伙食和营养都不能达到标准。根据新规划﹐穆斯林学校应当一视同仁﹐保证达到国家基本办学的标准。在国会的辩论中﹐多数议员说﹐政府欠穆斯林文化和经济的债太多﹐过去的歧视政策﹐限制穆斯林发展﹐处处以天主教社会自居﹐制造民族分裂和引起穆斯林抗争。
  

　　现在实现了和平﹐国会应当表现民主和平等﹐以真诚的态度对待平等的菲律宾公民﹐才能保证全国民族和解与团结。  政府应当补还这些欠债﹐弥补过去的亏空﹐使天主教徒与穆斯林共同生活在一个大家庭中。    民族和解出现之后﹐全国公民都表达了赞成和欢呼﹐最近的民意调查显示﹐52%的菲律宾居民都对穆斯林有好感。大家认为帮助穆斯林提高教育水平﹐有利于南方的穆斯林融入共同的社会﹐创造机会发展经济和社会文化。   高级律师协会发表的声明说﹕“穆斯林社会很注意传统的伊斯兰教育﹐应当受到政府重视。  政府对他们的帮助将有助于民族团结﹐也有助于社会改良﹐提高社会道德。


　　马尼拉政府承认了南方的伊斯兰自治政府﹐在12000平方公里的土地上﹐生活着二百多万穆斯林居民。   这是根据1990年11月6日达成的协议﹐划定的地界﹐通过了第6734号共和国法案﹐穆斯林地区定为菲律宾国土的第十五区﹐但是连年的战争﹐彼此都没有征服对方﹐最后的和平协议是双方的共同胜利。   阿罗约总统最后批准莫洛民族解放阵线获得法律地位﹐组建当地自治的伊斯兰政府﹐保证南方的穆斯林享有全国公民平等的权利。